Damien BP – bio

English

Damien Biot-Pelletier, PhD

Postdoctoral fellow
Evolutionary systems biology

Biography

I was born and raised in Montréal, where I so far spent the better part of my life. With the specific goal to pursue a career in scientific research, I did my undergraduate studies in biochemistry at Université de Montréal, where I enjoyed my first research opportunities. I then moved to McGill University for a master’s degree in microbiology, doing crystallography with bacterial membrane proteins. After an internship in the Department of Physiology at UCLA, I joined the laboratory of Pr. Vincent Martin at Concordia University for a Ph.D. in biology, where I applied metagenomics and genome editing methods studying the determinants of selection in evolutionary engineering experiments with yeast. After this challenging and rewarding experience, during which I discovered the fascinating field of evolutionary biology, I joined the corporate R&D labs at Lallemand Inc, a company specialized in the development, production and distribution of yeast and bacteria products. In this role, I continued nourishing my interests in evolution, working on several evolutionary engineering projects with various microbes. To further pursue these interests, I joined the Landry lab in February 2019.

Research interests
 
My broader interest is in understanding how environmental conditions and population structure constrain the trajectory of microbial evolution. Specifically, I am interested in evolutionary responses, in particular compensatory evolution, to the fitness cost of beneficial alleles. Therefore, I have a keen interest in epistasis, and antagonistic pleiotropy. I thrive designing and executing evolution experiments, and thoroughly enjoy genomics and computational biology work.

Publications

Biot-Pelletier D, Pinel D, Larue K, Martin VJJ, Determinants of selection in yeast evolved by genome shuffling. Biotechnol Biofuels. 11:282 (2018)

Biot-Pelletier D, Martin VJ, Seamless site-directed mutagenesis of the Saccharomyces cerevisiae genome using CRISPR-Cas9. J Biol Eng. 10:6 (2016)

Sverzhinsky A, Fabre L, Cottreau AL, Biot-Pelletier DM, Khalil S, Bostina M, Rouiller I, Coulton JW, Coordinated rearrangements between cytoplasmic and periplasmic domains of the membrane protein complex ExbB-ExbD of Escherichia coli. Structure 22(5):791-7 (2014)

Biot-Pelletier D, Martin VJ, Evolutionary engineering by genome shuffling. Appl Microbiol Biotechnol. 98(9):3877-87 (2014)

Français

Damien Biot-Pelletier, PhD 

Postdoctorant
Biologie évolutive des systèmes

Biographie

Je suis né et j’ai grandi à Montréal, on j’ai passé le plus clair de mes jours jusqu’à maintenant. Dans le but précis de poursuivre une carrière dans la recherche scientifique, j’ai fait mes études de premier cycle en biochimie à l’Université de Montréal, où j’ai également connu mes premières expériences en recherche. J’ai ensuite fait une maîtrise en microbiologie à l’Université McGill, où j’ai travaillé en cristallographie des protéines membranaires bactériennes. Après un stage au département de physiologie à UCLA, j’ai rejoint le laboratoire du Pr Vincent Martin à l’Université Concordia pour un doctorat en biologie, où j’ai étudié les déterminants de la sélection lors d’expériences d’ingénierie évolutive chez la levure, notamment à l’aide d’approches métagénomiques et d’édition de génome. Suite à cette expérience aussi stimulante qu’enrichissante, durant laquelle j’ai découvert le domaine fascinant de la biologie de l’évolution, j’ai intégré les laboratoires de recherche corporatifs de Lallemand Inc, une compagnie spécialisée dans le développement, la production et la distribution de produits de levures et de bactéries. À ce poste, j’ai continué à nourrir mes intérêts pour l’évolution en travaillant sur plusieurs projets d’ingénierie évolutive impliquant divers microbes. Dans le but de poursuivre et développer ces intérêts, je me suis joint au labo Landry en février 2019.

Intérêts de recherche

J’ai un intérêt général pour les mécanismes par lesquels les conditions environnementales et la structure d’une population orientent la trajectoire de l’évolution microbienne. Plus spécifiquement, je suis intéressé par les réponses évolutives, en particulier l’évolution compensatoire, au coût d’adaptation des allèles bénéfiques. Ainsi, j’entretiens un intérêt marqué pour l’épistasie, et la pléiotropie antagoniste. J’éprouve beaucoup de plaisir à concevoir et mener des expériences d’évolution en laboratoire, et j’apprécie le travail en génomique et en biologie computationnelle.

Publications

Biot-Pelletier D, Pinel D, Larue K, Martin VJJ, Determinants of selection in yeast evolved by genome shuffling. Biotechnol Biofuels. 11:282 (2018)

Biot-Pelletier D, Martin VJ, Seamless site-directed mutagenesis of the Saccharomyces cerevisiae genome using CRISPR-Cas9. J Biol Eng. 10:6 (2016)

Sverzhinsky A, Fabre L, Cottreau AL, Biot-Pelletier DM, Khalil S, Bostina M, Rouiller I, Coulton JW, Coordinated rearrangements between cytoplasmic and periplasmic domains of the membrane protein complex ExbB-ExbD of Escherichia coli. Structure 22(5):791-7 (2014)

Biot-Pelletier D, Martin VJ, Evolutionary engineering by genome shuffling. Appl Microbiol Biotechnol. 98(9):3877-87 (2014)