Honey J – bio

English

Honey Jain

MSc Student
Protein-protein interaction

Biography

I have always been curious about how interactions between small molecules can determine the fate of life or death. To learn more about life sciences and to understand the mechanisms involved in various biological processes, I did a MSc in Biological Sciences at the Birla Institute of Technology and Science in Goa, India. I also took the opportunity to learn engineering by pursuing a Bachelor degree in Electrical and Electronics Engineering.

While working on my course project of Biochemistry, I found my major field of interest which involved protein-protein interactions. To improve my knowledge in the field of Bioinformatics and Computational Biology, I pursued an internship at the Unité de glycobiologie structurale et fonctionnelle (UGSF-CNRS) in Lille, France. This internship gave me access to a lot of literature and a direct work experience on developing protein database like Score_set database which involved protein-protein docking and computational modeling of biomolecular interaction.

Now, I am in my fifth year at the university and I am working as a Mitacs Globalink Intern with Christian Landry’s Laboratory to study the evolution of protein-protein interactions.

Research interests

My research interests involve the study of protein-protein interactions using various computational approaches. My present project focuses on the study of protein-protein interaction evolution by simulating the evolution of protein complexes using crystal structures. I also use the estimation of binding energies to measure the protein stability and specific fitness functions implemented in different computational approaches such as FoldX and RosettaScripts to measure mutation effects on protein complex formation.

Publications

Français

Honey Jain

Etudiante à la Maitrîse
Interaction protéine-protéine

Biographie

J’ai toujours été curieuse de savoir comment les interactions entre les petites molécules peuvent déterminer le destin de la vie ou de la mort. Pour en savoir plus sur les sciences de la vie et comprendre les mécanismes impliqués dans divers processus biologiques, j’ai fait une maitrise en sciences biologiques à l’Institut Birla de technologie et des sciences, à Goa, en Inde. J’ai aussi profité de l’occasion pour apprendre l’ingénierie en poursuivant simultanément un baccalauréat en génie électrique et électronique.

En travaillant sur mon projet de biochimie, j’ai trouvé mon principal domaine d’intérêt, celui des interactions protéine-protéine. Pour parfaire mes connaissances dans le domaine de la bioinformatique et de la biologie computationnelle, j’ai effectué un stage à l’unité de glycobiologie structurale et fonctionnelle (UGSF-CNRS) à Lille, en France. Ce stage m’a permis d’acquérir de nombreuses ressources littéraires et une expérience de travail directe sur le développement d’une base de données sur les protéines, comme la base de données Score_set, qui inclue l’ancrage protéine-protéine et la modélisation computationnelle de l’interaction biomoléculaire.

Je suis actuellement en cinquième année à l’université et je travaille comme stagiaire Mitacs Globalink au Laboratoire Christian Landry pour étudier l’évolution des interactions protéine-protéine.

Intérêts de recherche

Mes intérêts de recherche impliquent l’étude des interactions protéine-protéine en utilisant diverses approches de calcul. Mon projet se concentre sur l’étude de l’évolution des interactions protéine-protéine en simulant l’évolution des complexes protéiques en utilisant les structures cristallines. J’utilise également l’estimation des énergies de liaison pour mesurer la stabilité des protéines et des fonctions de fitness spécifiques de différentes approches computationnelles, telle que FoldX et RosettaScripts, pour mesurer l’effet des mutations sur la formation des complexes.

Publications