Diana A – bio

English

Diana Ascencio, PhD 

Postdoctoral fellow
Evolutionary systems biology

Biography

I am from Texcoco, a small town in the hearth of Mexico. I have a degree in biochemical engineering from the ENCB-IPN, where I developed a passion for experimental work in the lab. I obtained a MSc and then a PhD degree from LANGEBIO-CINVESTAV Irapuato-México, working on understanding how gene duplication influences the evolution of gene function under the supervision of Dr Alexander de Luna. During my graduate studies, I worked on several projects: the effects of whole genome duplication on the evolutionary rates of paralogous genes, phenotypic and molecular effects of increasing gene dosage of essential genes, and phenotypic divergence of cis-regulatory and coding regions of duplicated genes, using the budding yeast as a model system. In 2014, I did an internship in the Landry Lab where I also acquired a deep interest in investigating the effects of changes in gene dosage on the dynamics of protein-protein interactions. My scientific experience includes: high throughput techniques of yeast functional genetics, general techniques of molecular biology, flow cytometry, data analysis and data visualization.

Research interests

Since paralogous genes are the main source of functional innovation and, ultimately, the main source of the great phenotypic variation we can see in our natural world, I am interested in the study of the mechanisms of fixation, immediate consequences and functional divergence of duplicated genes.

Publications

Espinosa-Cantu A, Ascencio DI, Herrera-Basurto S, Xu J, Roguev A, Krogan NJ & DeLuna A, Protein moonlighting revealed by non-catalytic phenotypes of yeast enzymes. Genetics 208:419-431 (2018)

Ascencio D, Ochoa S, Delaye L, & DeLuna A, Increased rates of protein evolution and asymmetric deceleration after the whole-genome duplication in yeasts. BMC Evolutionary Biology 17:40 (2017)

Diss G, Gagnon-Arsenault I, Dion-Coté AM, Vignaud H, Ascencio DI, Berger CM & Landry CR, Gene duplication can impart fragility, not robustness, in the yeast protein interaction network. Science 355:630-634 (2017)

Espinosa-Cantú A, Ascencio D, Barona-Gómez F & DeLuna A, Gene duplication and the evolution of moonlighting proteins. Frontiers in Genetics 6:227 (2015)

Diss G, Ascencio D, DeLuna A & Landry CR, Molecular mechanisms of paralogous compensation and the robustness of cellular networks. Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution 322:488-499 (2014)

Ascencio D & DeLuna A, Genetic Redundancy. In: Dubitzky W, Wolkenhauer O, Yokota H, Cho KH (eds) Encyclopedia of Systems Biology. Springer (2012)

Français

Diana Ascencio, PhD 

Postdoctorante
Biologie évolutive des systèmes

Biographie

Je viens de Texcoco, une petite ville au cœur du Mexique. J’ai un diplôme en génie biochimique de l’ENCB-IPN, où j’ai développé mon gout pour le travail de laboratoire expérimental. J’ai obtenu ma maîtrise puis mon doctorat à LANGEBIO-CINVESTAV Irapuato-México, travaillant à comprendre comment la duplication des gènes influence l’évolution de leurs fonctions, sous la supervision d’Alexander de Luna. Pendant mes études supérieures, j’ai travaillé sur plusieurs projets : les impacts de la duplication du génome entier sur les taux évolutifs des gènes paralogues, les impacts phénotypiques et moléculaires de l’augmentation du dosage des gènes essentiels et l’impact de la divergence phénotypique des régions cis-régulatrices et codantes de gènes dupliqués, en utilisant la levure bourgeonnante comme modèle d’étude. En 2014, j’ai effectué un stage au Landry Lab où j’ai également acquis un grand intérêt pour l’impact des changements de dosage des gènes sur la dynamique des interactions protéine-protéine chez la levure. Mon expérience scientifique comprend : les techniques à haut débit de la génétique fonctionnelle des levures, les techniques générales de biologie moléculaire, la cytométrie en flux, l’analyse des données et la visualisation.

Intérêts de recherche

Puisque les gènes paralogues sont la principale source d’innovation fonctionnelle et, finalement, de la grande variation phénotypique que nous pouvons observer dans notre monde naturel, je m’intéresse à l’étude des mécanismes de fixation, des conséquences immédiates et de la divergence fonctionnelle des gènes dupliqués.

Publications

Espinosa-Cantu A, Ascencio DI, Herrera-Basurto S, Xu J, Roguev A, Krogan NJ & DeLuna A, Protein moonlighting revealed by non-catalytic phenotypes of yeast enzymes. Genetics 208:419-431 (2018)

Ascencio D, Ochoa S, Delaye L, & DeLuna A, Increased rates of protein evolution and asymmetric deceleration after the whole-genome duplication in yeasts. BMC Evolutionary Biology 17:40 (2017)

Diss G, Gagnon-Arsenault I, Dion-Coté AM, Vignaud H, Ascencio DI, Berger CM & Landry CR, Gene duplication can impart fragility, not robustness, in the yeast protein interaction network. Science 355:630-634 (2017)

Espinosa-Cantú A, Ascencio D, Barona-Gómez F & DeLuna A, Gene duplication and the evolution of moonlighting proteins. Frontiers in Genetics 6:227 (2015)

Diss G, Ascencio D, DeLuna A & Landry CR, Molecular mechanisms of paralogous compensation and the robustness of cellular networks. Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution 322:488-499 (2014)

Ascencio D & DeLuna A, Genetic Redundancy. In: Dubitzky W, Wolkenhauer O, Yokota H, Cho KH (eds) Encyclopedia of Systems Biology. Springer (2012)