Axelle M – bio

English

Axelle Marchant, PhD 

Postdoctoral fellow
Evolutionary systems biology

Biography

Originally from France, I started my studies at the University Pierre and Marie Curie (Paris VI) to become a teacher in Biology and Geology (Bachelor – Teaching Science of Life and Earth – 2009). Through contact with university professors during this training, I acquired a taste for research. I changed my training paths to join the master’s program in Molecular and Cellular Biology, with a Genetics and Management of Biodiversity option (2011). I did my first research internship in eco-epidemiology at the National Borrelia Center at the Pasteur Institute in Paris under the direction of Elisabeth Ferquel and Valérie Chaumet. This internship convinced me that my career move was the right choice. I continued my studies with a PhD at the University Paris Sud XI, EGCE laboratory under the supervision of Myriam Harry and Florence Mougel. I defended my thesis in adaptive biology in 2016. I am currently a postdoctoral fellow in evolutionary genetics and proteomics in the Landry laboratory and this, since July 2016.
My areas of expertise are molecular biology, microbiology, high throughput sequencing analysis, proteomics, bioinformatics, scientific communication, student training, teaching and event organization.

Research interests

I am interested in the consequences of anthropogenic environmental changes on vector-borne diseases, including Lyme disease and Chagas disease. During my master’s degree, I showed that introduction of chipmunk by humans in a French forest could contribute to the increase of infection rate of Lyme disease vectors. I discovered during my PhD several multigenic families that could be involved in the adaptation of Chagas disease vectors to the human environment. This work allowed to understand the importance of gene duplication as a mechanism of evolution. For my post-doc, I chose to continue my research on the function of duplicated genes at other levels of organization, including at the proteome level. I am therefore interested in protein-protein interactions (PPI) related to duplicate proteins. I am currently working on the link between the retention of paralogs and homodimerization as well as on the evolution of the reorganization of PPI within protein complexes after a duplication event.

Publications

Marchant A, Coupanec AL, Joly C, Perthame E, Sertour N, Garnier M, Godard V, Ferquel E & Choumet V, Infection of Ixodes ricinus by Borrelia burgdorferi sensu lato in peri-urban forests of France. PLoS ONE 12:e0183543 (2017)

Marsit S, Leducq JB, Durand É, Marchant A, Filteau M & Landry CR, Evolutionary biology through the lens of budding yeast comparative genomics. Nature Review Genetics 18:581–598 (2017)

Marchant A, Mougel F, Jacquin-Joly E, Costa J, Almeida CE & Harry M, Under-expression of chemosensory genes in domiciliary bugs of the chagas disease vector Triatoma brasiliensis. PLoS Neglected Tropical Diseases 10:e0005067 (2016)

Marchant A, Mougel F, Mendonça V, Quartier M, Jacquin-Joly E, da Rosa JA, Petit E & Harry M, Comparing de novo and reference-based transcriptome assembly strategies by applying them to the blood-sucking bug Rhodnius prolixus. Insect Biochemistry and Molecular Biology 69:25–33 (2016)

Marchant A, Mougel F, Almeida C, Jacquin-Joly E, Costa J & Harry M, De novo transcriptome assembly for a non-model species, the blood-sucking bug Triatoma brasiliensis, a vector of Chagas disease. Genetica 143:225–239 (2015)

 

Français

Axelle Marchant, PhD 

Postdoctorante
Biologie évolutive des systèmes

Biographie

Originaire de France, j’ai débuté mes études à l’Université Pierre et Marie Curie (Paris VI) dans un cursus pour devenir enseignante en Biologie et en Géologie (Licence – enseignement Science de la Vie et de la Terre – 2009). C’est durant ce parcours, au contact de mes professeurs universitaires, que j’ai pris goût pour la recherche. Je me suis alors réorientée en recherche dans le programme de Master en Biologie Moléculaire et Cellulaire, option Génétique et Gestion de la Biodiversité (2011). J’ai réalisé mon premier stage de recherche en éco-épidémiologie au centre national des Borrelia à l’Institut Pasteur de Paris sous la direction d’Elisabeth Ferquel et Valérie Chaumet. Ce stage m’a convaincu que mon choix de réorientation était le bon. J’ai poursuivi mes études au doctorat à l’Université Paris Sud XI, au laboratoire EGCE sous la direction de Myriam Harry et Florence Mougel. J’ai soutenu ma thèse en biologie adaptative en 2016. Je suis post-doctorante en génétique et protéomique évolutive dans le laboratoire Landry depuis juillet 2016.
Mes domaines d’expertise sont la biologie moléculaire, la microbiologie, l’analyse de séquençage à haut débit, la protéomique, la bio-informatique, la communication scientifique, la formation d’étudiant, l’enseignement et l’organisation d’événements.

Intérêts de recherche

Dans un premier temps, je me suis intéressée aux conséquences des modifications anthropiques de l’environnement sur les maladies vectorielles, notamment la maladie de Lyme et la maladie de Chagas. J’ai montré durant mon master que l’introduction de tamia par l’homme dans les forêts de France pourrait contribuer à l’augmentation du taux d’infection des vecteurs de la maladie de Lyme. J’ai découvert durant ma thèse plusieurs familles multigéniques pouvant être impliquées dans l’adaptation des vecteurs de la maladie de Chagas au milieu anthropique. Ce travail m’a permis de découvrir l’importance du mécanisme de duplication de gènes au cours de l’évolution. Pour mon post-doctorat, j’ai choisi de poursuivre mes recherches sur la fonction des gènes dupliqués à d’autres niveaux d’organisation notamment protéomique. Je m’intéresse donc aux interactions protéines-protéines (PPI) en lien avec des protéines dupliquées. Je travaille sur le lien entre rétention des paralogues et homodimérisation ainsi que sur l’évolution de la réorganisation des PPI au sein de complexes de protéines après un événement de duplication.

Publications

Marchant A, Coupanec AL, Joly C, Perthame E, Sertour N, Garnier M, Godard V, Ferquel E & Choumet V, Infection of Ixodes ricinus by Borrelia burgdorferi sensu lato in peri-urban forests of France. PLoS ONE 12:e0183543 (2017)

Marsit S, Leducq JB, Durand É, Marchant A, Filteau M & Landry CR, Evolutionary biology through the lens of budding yeast comparative genomics. Nature Review Genetics 18:581–598 (2017)

Marchant A, Mougel F, Jacquin-Joly E, Costa J, Almeida CE & Harry M, Under-expression of chemosensory genes in domiciliary bugs of the chagas disease vector Triatoma brasiliensis. PLoS Neglected Tropical Diseases 10:e0005067 (2016)

Marchant A, Mougel F, Mendonça V, Quartier M, Jacquin-Joly E, da Rosa JA, Petit E & Harry M, Comparing de novo and reference-based transcriptome assembly strategies by applying them to the blood-sucking bug Rhodnius prolixus. Insect Biochemistry and Molecular Biology 69:25–33 (2016)

Marchant A, Mougel F, Almeida C, Jacquin-Joly E, Costa J & Harry M, De novo transcriptome assembly for a non-model species, the blood-sucking bug Triatoma brasiliensis, a vector of Chagas disease. Genetica 143:225–239 (2015)